呼吸疾病国家重点实验室是依托广州医科大学于2007年10月获国家科技部批准建设的我国呼吸疾病研究领域唯一的国家重点实验室，以呼吸疾病应用基础研究为重点，以转化医学为发展战略，以提高我国呼吸系统疾病防治水平为目标，专注于严重影响国民健康的重大、常见和多发的呼吸系统疾病开展研究。近年来形成了重大呼吸道传染病与肺损伤、慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘和慢性咳嗽、支气管肺癌、肺纤维化与肺结核病、呼吸研究成果产业化、呼吸相关与交叉学科研究七大优势研究方向。