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呼吸内科是一个集临床、教学、科研及管理为一体的学科。

胸外科是国家呼吸疾病临床医学中心、呼吸疾病国家重点实验室的肺癌学组学术带头团队，2010年联合美国加州大学三藩市分校建立了中美肺癌联合转化医学实验室。

重症医学科从上世纪70年代中后期作为集中抢救COPD、呼吸衰竭为主、并发循环及肾功能等多脏器功能衰竭病人的重症救治病房。

泌尿外科是卫生部国家临床重点专科、广州市和广东省重点学科以及广东省泌尿外科重点实验室的依托单位。

变态反应学科创建于1983年，创建人钟南山院士。

耳鼻咽喉头颈外科是国内最先开展睡眠监测、内科及外科治疗的学科，是“粤港澳大湾区睡眠联盟”主任单位

中医结合病区是以中医为主导，中西医并举，传统医学治疗特色鲜明的综合型临床科室。

我院器官移植科是国家卫生部首批认证取得肺移植手术资质的医疗单位之一，也是国内少数能够同时开展肺脏移植、心脏移植、肝脏移植、肾脏移植，以及心肺联合移植的医疗机构之一。

肿瘤科集中全院专科优势资源，致力于打造成国内领先的肿瘤防治中心。